Anonyymi
Et ole kirjautunut
Keskustelu
Muokkaukset
Luo tunnus
Kirjaudu sisään
ApoWiki
Haku
Muokataan sivua
Poimintaongelma (biokemia)
ApoWikistä
Nimiavaruudet
Sivu
Keskustelu
Lisää
Lisää
Sivun toiminnot
Lue
Muokkaa
Historia
Varoitus:
Et ole kirjautunut sisään. IP-osoitteesi näkyy julkisesti kaikille, jos muokkaat. Jos
kirjaudut sisään
tai
luot tunnuksen
, muokkauksesi yhdistetään käyttäjänimeesi ja saat paremman käyttökokemuksen.
Tämä muokkaus näyttää olevan jo kumottu.
Mainosroskan tarkastus.
Älä
täytä tätä!
'''Poimintaongelma''' (engl. ''sampling problem'') liittyy kysymykseen, miten yleistä peptidisekvenssien biologinen aktiivisuus on. Kysymyksen voi muotoilla täsmällisemmin mutta jonkin verran vaikeatajuisemmin: mikä on tietynpituisten biologisesti aktiivisten peptidisekvenssien lukumäärän (eli niiden muodostaman sekvenssialiavaruuden koon) suhde kaikkien mahdollisten samanpituisten peptidisekvenssien lukumäärään (eli niiden muodostaman sekvenssiavaruuden kokoon)? Tämä kysymyksenasettelu on tärkeä pyrittäessä arvioimaan [[evoluutioteoria|evoluutioteoreettisten]] mekanismien selitysriittävyyttä<ref>Jollekin havainnolle ehdotetun tietyn syntytavan selitysriittävyys (engl. ''explanatory sufficiency'') liittyy kysymykseen siitä, miten todennäköisesti tämä selitystarjokas riittäisi (olemassaollessaan, esiintyessään, voimassaollessaan tai toteutuessaan) saamaan aikaan havaitun selitettävän ilmiön: mitä todennäköisemmin näin tapahtuu, sitä riittävämpi kyseinen syntyskenaario on.</ref> ja selitysuskottavuutta<ref>Ehdotetun selityksen selitysuskottavuus (engl. ''explanatory likelihood'') riippuu suoraan sekä sen selitysriittävyydestä (engl. ''explanatory sufficiency'') että sen (olemassaolon, esiintymisen, voimassaolon tai toteutumisen) omasta (selitettävän ilmiön esiintymisestä riippumattomasta) alkuperäistodennäköisyydestä (engl. ''prior probability'').<br />Eri selitystapojen keskinäinen paremmuusvertailu on palautettavissa niiden selitysuskottavuusvertailuun: selityksen paremmuus (ja vastaavasti huonommuus) liittyy olennaisesti sen uskottavuuteen – uskottavin selitys täyttää selittämistehtävän parhaiten, ja näin ollen sitä voi perustellusti pitää parhaana selityksenä. Toisaalta selityksiltä voi ylipäänsäkin vaatia jonkinlaista vähimmäisuskottavuutta: jos selitys on liian epäuskottava, siihen ei ole mielekästä pitäytyä edes parempien selitysten puutteessakaan, vaan tällöin on järkevämpää myöntää, ettei kyseiselle havaintoilmiölle toistaiseksi tunneta mitään nykytiedon valossa mahdollista selitystä.</ref> eri proteiinien väitettyinä aikaansaajina. ==Esimerkkejä== ===β-laktamaasi=== Penisilliiniä hajottavan β-laktamaasientsyymin pituus on 153 aminohappoa. Kaikkia saman entsymaattisen funktion toteuttavia 153 aminohapon mittaisia sekvenssejä ei kylläkään pystytä tarkasti laskemaan, mutta koodisekvenssianalyysiin perustuva estimointi on antanut niiden lukumäärän (sekvenssialiavaruuden koon) suuruusluokka-arvioksi 10<sup>122</sup>. Käytettävissä olevista 20 proteogeenisestä aminohaposta muodostettavissa olevien, 153 aminohapon mittaisten eri sekvenssien lukumäärä (sekvenssiavaruuden koko) on kaikkiaan 20<sup>153</sup> ≈ 10<sup>199</sup>. Toisin sanoen todennäköisyys sille, että tästä sekvenssiavaruudesta sattumanvaraisesti poimittu sekvenssi ''S'' kuuluisi kyseiseen sekvenssialiavaruuteen eli että sillä olisi ko. entsymaattinen funktio ''E'', on yhtä kuin p(''E''|''S'') ≈ 10<sup>122</sup>/10<sup>199</sup> = 10<sup>-77</sup>. <ref name = "EvoKriitAna" >{{Kirjaviite | Tekijä = Siegfried Scherer, Reinhard Junker | Nimeke = [[Evoluutio – kriittinen analyysi (kirja)| Evoluutio – kriittinen analyysi]] (2. suomalainen painos) | Julkaisija = Datakirjat | Vuosi = 2007 | Kappale = | Sivu = 329 | Selite = | Tunniste = 978-951-98558-4-4}} </ref>{{,}}<ref name="Axe2004"> {{cite journal |last1=Axe |first1=Douglas D. |title=Estimating the Prevalence of Protein Sequences Adopting Functional Enzyme Folds |journal=Journal of Molecular Biology |volume=341 |issue=5 |year=2004 |pages=1295–1315 |issn=00222836 |doi=10.1016/j.jmb.2004.06.058}} </ref> {{ElamanKehitys}} ==Viitteet== {{viitteet|sarakkeet}} [[Luokka:Suunnitteluteoria]]
Yhteenveto:
Muutoksesi astuvat voimaan välittömästi.
Kaikki ApoWikiin tehtävät tuotokset katsotaan julkaistuksi GNU Free Documentation License 1.3 or later -lisenssin mukaisesti (
ApoWiki:Tekijänoikeudet
). Jos et halua, että kirjoitustasi muokataan armottomasti ja uudelleenkäytetään vapaasti, älä tallenna kirjoitustasi. Tallentamalla muutoksesi lupaat, että kirjoitit tekstisi itse, tai kopioit sen jostain vapaasta lähteestä.
ÄLÄ KÄYTÄ TEKIJÄNOIKEUDEN ALAISTA MATERIAALIA ILMAN LUPAA!
Peruuta
Muokkausohjeet
(avautuu uuteen ikkunaan)
Tällä sivulla käytetyt mallineet:
Malline:,
(
muokkaa
)
Malline:Cite journal
(
näytä wikiteksti
) (suojattu)
Malline:ElamanKehitys
(
näytä wikiteksti
) (osittain suojattu)
Malline:Kirjaviite
(
näytä wikiteksti
) (suojattu)
Malline:Navbox
(
näytä wikiteksti
) (suojattu)
Malline:Navbox subgroup
(
näytä wikiteksti
) (suojattu)
Malline:Viitteet
(
näytä wikiteksti
) (suojattu)
Malline:·
(
näytä wikiteksti
) (suojattu)
Moduuli:Arguments
(
näytä wikiteksti
) (suojattu)
Moduuli:Navbar
(
näytä wikiteksti
) (suojattu)
Moduuli:Navbox
(
näytä wikiteksti
) (suojattu)
Valikko
Valikko
Etusivu
Kahvihuone
Ilmoitustaulu
Lukusuositukset
Tuoreet muutokset
Luokkahakemisto
Satunnainen sivu
Kiitokset
Linkit
Ohje
Wiki-työkalut
Wiki-työkalut
Toimintosivut
Sivutyökalut
Sivutyökalut
Käyttäjäsivun työkalut
Lisää
Tänne viittaavat sivut
Linkitettyjen sivujen muutokset
Sivun tiedot
Sivun lokit